Audyt wewnętrzny obowiązuje w jednostkach sektora finansów publicznych dla zapewnienia ich właściwego funkcjonowania. Kontrolą wewnętrzną w tych jednostkach mogą zajmować się jedynie osoby posiadające uprawnienia audytora wewnętrznego. Od 1 stycznia 2010 roku, zgodnie z ustawą o finansach publicznych z dnia 27 sierpnia 2009 roku (tekst jednolity Dz. U. z 2017 r., poz. 2077 z późn. zm., art. 286) audytorem wewnętrznym może być między innymi osoba, która posiada dwuletnią praktykę w zakresie audytu wewnętrznego i legitymuje się dyplomem ukończenia studiów podyplomowych w zakresie audytu wewnętrznego, wydanym przez jednostkę organizacyjną, która w dniu wydania dyplomu była uprawniona, zgodnie z odrębnymi ustawami, do nadawania stopnia naukowego doktora nauk ekonomicznych lub prawnych.Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu spełnia wymóg postawiony w ustawie.Ukończenie studiów umożliwia zatem uzyskanie kwalifikacji audytora wewnętrznego w jednostkach sektora finansów publicznych w myśl wyżej wymienionej ustawy.