Bioinformatyka i biostatystyka w biologii i medycynie

Świadectwo ukończenia studów

Absolwent zna i rozumie:

• Pojęcia z zakresu terminologii biologii molekularnej
• Struktury i funkcje kwasów nukleinowych oraz ich organizację w komórkach prokariotycznych i eukariotycznych, a także genom człowieka
• Mechanizmy związane z kwasami nukleinowymi: replikację, transkrypcję, translację, regulację ekspresji genów, mutagenezę i naprawę DNA
• Techniki laboratoryjne w biologii molekularnej, w szczególności izolację oraz analizę jakościową i ilościową kwasów nukleinowych, techniki sekwencjonowania
• Zasady organizacji, zarządzania i pracy w laboratorium biologii molekularnej, Dobrą Praktykę Laboratoryjną oraz zasady BHP
• Metodologię badań naukowych oraz narzędzia bioinformatyczne i biostatystyczne do analizy wyników badań
• Podstawy korzystania z programów specjalistycznych w systemie Linux i na platformach takich jak qiime2, bwa, star, gatk
• Bazy danych biologicznych oraz metody ich przetwarzania
• Zastosowanie technik biologii molekularnej, zwłaszcza sekwencjonowania NGS w biologii i medycynie
• Narzędzia do analizy mikrobiomu człowieka

Absolwent potrafi:

• Wykorzystywać terminologię z zakresu genetyki molekularnej, bioinformatyki i biostatystyki w pracy laboratoryjnej i opracowywaniu danych
• Dobierać odpowiednie techniki biologii molekularnej do konkretnych zastosowań praktycznych
• Stosować narzędzia statystyczne do analizy danych ilościowych i jakościowych w dużych zbiorach danych
• Zaplanować badanie z zastosowaniem techniki NGS, przygotować dokumentację badania (uzasadnienie, analiza SWOT, harmonogram, kosztorys, raport)
• Przeszukiwać i analizować bazy danych biologicznych (np. sekwencje nukleotydowe i aminokwasowe)
• Analizować i interpretować dane wielkoformatowe przy użyciu specjalistycznych narzędzi bioinformatycznych
• Przeprowadzać analizę danych biologicznych z użyciem specjalistycznych pakietów i serwisów internetowych bioinformatycznych
• Pracować w systemie Linux i korzystać z narzędzi takich jak qiime2, bwa, star, gatk
• Interpretować wyniki badań molekularnych, zwłaszcza WES i WGS, identyfikować punkty krytyczne i znaczenie kliniczne
• Stosować narzędzia do analizy mikrobiomu człowieka
• Obsługiwać aparaturę stosowaną w biologii molekularnej
• Przestrzegać zasad Dobrej Praktyki Laboratoryjnej
• Izolować i zabezpieczać kwasy nukleinowe z różnych materiałów oraz analizować ich jakość i ilość
• Przygotować bibliotekę DNA według protokołu sekwencjonowania NGS

Absolwent jest gotów do:

• Przestrzegania zasad etyki zawodowej i reguł obowiązujących w pracy badawczo-rozwojowej
• Samodzielnej i zespołowej pracy
• Samodzielnego pogłębiania wiedzy i krytycznej oceny źródeł naukowych

Możliwości zatrudnienia/typowe miejsca pracy: Laboratoria diagnostyczne biologii molekularnej, laboratoria naukowe realizujące badania z zakresu biologii molekularnej, bioinformatyki i biostatystyki.